8月7日，弘彬向Jellyfish娛樂表達想退團的意願，在慎重討論後，公司決定尊重個人意願，與其退團，宣布此後VIXX以五人組形式活動。 8月28日，發佈VIXX LR第二張迷你專輯《Whisper》，並公開同名主打歌《Whisper》MV和全輯音源。
4月19日，發行第六張韓語單曲專輯《Zelos》，主打歌為《炸藥》，於同日公開音樂錄影帶，正式為《VIXX 2016 CONCEPTION》揭開序幕。 2月24日，發行特別單曲專輯《Boy’s Record》，主打歌翻唱前輩Re.f的《離別公式》，專輯也收錄LEO和RAVI在第一次單獨演唱會公開的自創曲《寒冷的夜晚》和《Memory》。 2月12日，公開特別單曲專輯《Boys’ Record》和主打歌MV的發佈日期，並在官方Youtube頻道發佈先行預告，宣布回歸消息和即將舉行的第二次單獨演唱會的日期。 8月7日，在官方Youtube頻道發布預告，片段中播放成員LEO和RAVI在演唱會的片段，最後二人名字的首字母融為一體，正式宣布團體出道以來首個子團誕生，子團成員為Leo及Ravi，名為VIXX LR。 11月2日，LEO第三首數位單曲《남아있어(I’m Still Here)》公開音源與MV，發行後進入芬蘭、紐西蘭、澳洲、俄羅斯、新加坡、德國、臺灣的iTunes K-POP排行榜 TOP10。 6月17日，LEO發行第二張迷你韓語專輯 《Muse》，並公開主打歌《Romanticism》MV和全輯音源。
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10月-11月，分別在美國、義大利、瑞典、馬來西亞、日本和南韓舉行了首個全球巡迴ShowcaseThe Milkey Way。 5月20日，發行以’雙面博士概念’為主的首張迷你專輯《Hyde》，並公開主打歌《Hyde》MV和全輯音源，MV內含有血腥畫面被列為19禁。 12月5日，參與公司Jellyfish娛樂的冬日計劃Jelly nvixx nvixx Christmas 2012 heart project，發佈與同公司藝人朴孝信、成詩京、李錫勳、徐仁國合作的聖誕單曲《因為是聖誕》。 nvixx 11月3日，Jellyfish娛樂宣布N合約到期，經過長時間討論後決定不續約；但將繼續參與VIXX的團體活動。
3月18日，為紀念正式打入華語市場，特別推出翻唱自台灣歌手庾澄慶的經典作品《命中注定》，並收錄在《Boy’s Record》台壓版專輯內，MV也在台灣第一次粉絲見面會《VIXX星光之夜台北見面會》中取景。 7月18日-20日，為期三天於韓國舉行VIXX LIVE FANTASIA 《VIXX世界巡迴演唱會》，並依序至日本、匈牙利以及波蘭。 6月8日，Jellyfish娛樂宣布與HYUK專屬合約最近到期，經過長時間的討論後，在雙方協議下決定不進行續約，離開公司；但將繼續參與VIXX的團體活動。 5月24日，Jellyfish Entertainment 宣布與LEO、KEN、弘彬與HYUK續約，而RAVI決定離開公司並建立自己的工作室，但將繼續參與VIXX的團體活動；而隊長N將等退伍後再討論續約問題。 11月10日，正式推出第二張正規專輯《Chained up》，並公開同名主打歌《Chained up (사슬)》MV和全輯音源。 12月6日，在音樂銀行拿下出道以來首個一位，並在14日履行「一位公約」：在江南炸雞店與300名粉絲一起舉行炸雞派對。
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4月17日，發行第三張韓語正規專輯《EAU DE VIXX》，公開主打歌《香》MV和全輯音源，並於同日舉辦《EAU DE VIXX》回歸Showcase。 5月15日，發行第四張迷你專輯《桃源境(Shangri-La)》，並公開同名主打歌《桃源境(Shangri-La)》MV和全輯音源。 6月19日，在首爾奧林匹克體操競技場內舉行官方粉絲俱樂部「ST★RLIGHT」3期活動「VIXXCHOOL」。 3月-5月，舉行第二次單獨演唱會VIXX LIVE FANTASIA nvixx nvixx 並且在南韓、日本、菲律賓、新加坡等地進行巡迴演出。
