另一方面，京助看見啄木寫下帶著死亡意境的短歌，十分擔心他的安危，但胡堂等人卻完全不把他的擔心當一回事。 夏翊不想讓自己的秘密暴露，便說能幫林鹿追到荀楓，由此，一段懵懂的情感物語就此開始。 高中生偵探工藤新一，被稱為“日本警察的救世主”、“平成年代的福爾摩斯”。 一次在與青梅竹馬的女友毛利蘭去遊樂園遊玩時，發現兩個行動詭異的黑衣人。 新一跟蹤他們直到交易現場，另一個黑衣人趁其不注意從後面將他一棒擊倒，並灌下一種名為APTX4869的神秘毒藥企圖殺他滅口，但因為副作用他的身體竟回到發育期的孩童狀態。
- 新一跟蹤他們直到交易現場，另一個黑衣人趁其不注意從後面將他一棒擊倒，並灌下一種名為APTX4869的神秘毒藥企圖殺他滅口，但因為副作用他的身體竟回到發育期的孩童狀態。
- 為了代替身體不好的啄木進行調查，京助找了朔太郎和胡堂幫忙。
- 考慮到要是黑衣人知道他還活著的話，必將使周圍的親朋好友受到牽連，於是新一化名為“江戶川柯南”，寄住在毛利蘭的家中，想借助其父親、擔任偵探的毛利小五郎的力量來找尋黑衣人。
- 第7話【紳士怪盜】，發生了一起大公司被偷走所有職員薪水的事件。
- 第11話【逢魔時刻】，鎮上不停發生商家孩子被誘拐的事件，不過孩子們都會在幾天內平安出現。
- 高中生偵探工藤新一，被稱為“日本警察的救世主”、“平成年代的福爾摩斯”。
- 一次在與青梅竹馬的女友毛利蘭去遊樂園遊玩時，發現兩個行動詭異的黑衣人。
在某個事件中，赤井秀一的宿敵、代號為波本的安室透從FBI那打聽到了“線索”。 之後，安室透便深入調查赤井秀一與衝矢昴的關係。 在經過了一系列的高智商攻防戰後，赤井秀一的迴歸給所有人帶來了衝擊。
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與此同時，少年偵探隊盯上了海外超人氣偶像，他們二者之間有什麼聯繫呢？ 故事發生的當時是大正時代（1912年7月30日至1926年12月24日）14年，在上女子學校的小梅正好14歲。 某天，小梅和大家通稱“大小姐”的一位朋友進行了一番商量，希望組建一支女子棒球隊，來和男子棒球隊進行比賽……“我想請你和我一起打棒球”雖然個性倔強，但很少被稱為任性的“大小姐”晶子，卻突然說了這樣突兀的話。 其起因在某個宴會上碰上了一個令人厭惡的男人，而對方自豪的是棒球運動，這就成為了晶子想要用棒球打敗對方的原因。 在這個良家女子學校中，大家連棒球一無所知，也不知道會不會容許這種從沒有人做過的事情。 即使如此，仍然聚集了一群贊成晶子的話的女學生們。
第7話【紳士怪盜】，發生了一起大公司被偷走所有職員薪水的事件。 雖然警方以現場遺留的香菸為線索逮捕了犯人，但被偷走的薪水仍然不知去向，社長於是提出懸賞。 與啄木還在絕交中的京助，注意到來自犯人購買煙草店家的二錢銅幣上有機關，頓時興奮不已，從中找到貌似暗示隱藏地點的暗號後，京助撇下啄木，與平井少年一同挑戰解謎。 魯邦三世又給警察發去了通告，錢形警督開始組織刑警逮捕魯邦，而峰不二子出現在一個神秘的男子身邊。
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第11話【逢魔時刻】，鎮上不停發生商家孩子被誘拐的事件，不過孩子們都會在幾天內平安出現。 然而前來委託石川的成田屋家的孩子遭到誘拐已經一個月卻仍不知去向。 為了代替身體不好的啄木進行調查，京助找了朔太郎和胡堂幫忙。
考慮到要是黑衣人知道他還活著的話，必將使周圍的親朋好友受到牽連，於是新一化名為“江戶川柯南”，寄住在毛利蘭的家中，想借助其父親、擔任偵探的毛利小五郎的力量來找尋黑衣人。
真實身份謎團重重、每個人都有著複雜背景的危險一家——赤井家族。 在來葉崖假死的FBI探員赤井秀一，《名偵探柯南緋色的不在證明》以他為中心展開，揭開了赤井秀一、世良真純、羽田秀吉、瑪麗等人的個性，以及他們幾人之間的關係。 故事的高潮則在講述赤井秀一華麗復活的“緋色”系列。
- 即使如此，仍然聚集了一群贊成晶子的話的女學生們。
- 其起因在某個宴會上碰上了一個令人厭惡的男人，而對方自豪的是棒球運動，這就成為了晶子想要用棒球打敗對方的原因。
- 環曾與以「蝙蝠人」轟動一時的雜技演員—鑑，有過極為親密的關係，她聲稱在鑑因意外身亡後，遭到鑑的弟弟的恐嚇。
- 魯邦三世又給警察發去了通告，錢形警督開始組織刑警逮捕魯邦，而峰不二子出現在一個神秘的男子身邊。
- 第8話【年輕男子】，啄木吐血病倒不久後，女傭加世帶了名為環的委託人來見他。
而在這一連串的“不在場證明劇”的真相背後，都有著柯南的身影——《名偵探柯南》系列中不可缺少的赤井一家，該總集篇將徹底解剖他們至今為止的行動軌跡、以及他們與柯南的關係。 第8話【年輕男子】，啄木吐血病倒不久後，女傭加世帶了名為環的委託人來見他。 雖然啄木一度拒絕接受委託，但在聽聞環的生死觀及中性魅力吸引之下，決定接受委託。 環曾與以「蝙蝠人」轟動一時的雜技演員—鑑，有過極為親密的關係，她聲稱在鑑因意外身亡後，遭到鑑的弟弟的恐嚇。
調查途中成田屋的孩子卻忽然回來了。 另一方面，原本貌似隨著環死亡而告一段落的告發信事件又再度發生。 啄木主動表示要揪出真兇告發者Ｘ的真面目。 時代為明治末期苦於貧窮的天才歌人石川啄木，因一樁殺人事件為契機，開始以公寓為據點的偵探社操業。
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